La découverte de médicaments contre le cancer obtient un coup de pouce de la grande base de données 3d
L'ajout d'améliorations 3D à la plus grande base de données mondiale pour la recherche sur le cancer et la découverte de médicaments devrait constituer un énorme coup de pouce pour les chercheurs qui recherchent des moyens plus efficaces de développer de nouveaux traitements contre le cancer.
La base de données détient maintenant les structures 3D de près de 3 millions de niches à la surface de près de 110 000 molécules cancérogènes.
Ainsi, les chercheurs qui ont complété des mises à jour majeures à canSAR, une vaste base de données sur le cancer accessible au public qui s'appuie sur des connaissances provenant de domaines tels que la biologie, la chimie, la pharmacologie et la biologie structurale pour aider à interpréter les données expérimentales et à rendre les prédictions utiles pour la découverte de médicaments.
L'équipe, de l'Institute of Cancer Research (ICR) à Londres, au Royaume-Uni, décrit les nouvelles améliorations apportées à canSAR dans le journal Recherche sur les acides nucléiques .
Une caractéristique importante de la mise à jour est l'ajout de structures 3D de protéines défectueuses et de cartes des réseaux de communication du cancer.
D'autres améliorations comprennent une meilleure navigation et des outils de recherche, de nouveaux résumés de maladies et des lignes de cancer, et des outils améliorés d'analyse par lots, notez les auteurs du projet financé par le Cancer Research UK.
L'auteur principal Dr. Bissan Al-Lazikani, qui a dirigé le développement de canSAR, et dont la recherche à ICR se concentre sur le développement et l'application de techniques de calcul multidisciplinaires pour soutenir la découverte de médicaments, indique:
Notre objectif est que les scientifiques du cancer seront armés des données dont ils ont besoin pour mener une recherche de sauvetage sur les médicaments les plus excitants du futur ".
La base de données CANSAR se déploie depuis 2011 et vise à utiliser les «grandes données» pour construire une image détaillée de la façon dont la plupart des molécules humaines se comportent.
La base de données abrite déjà des milliards de mesures expérimentales qui répertorient l'effet d'un million de médicaments et de produits chimiques sur les protéines humaines. Il a également ajouté cette information avec les données génétiques et les résultats des essais cliniques.
Le Dr Al-Lazikani explique pourquoi la ressource est si utile:
"Les scientifiques doivent trouver toute l'information sur un gène ou une protéine défectueux pour comprendre si un nouveau médicament pourrait fonctionner. Ces données sont vastes et dispersées, mais la base de données CANSAR les rassemble et ajoute de la valeur en identifiant les liens cachés et en présentant la clé Informations facilement."
La plus grande base de données sur la découverte de médicaments contre le cancer dans le monde
La dernière mise à jour signifie que les chercheurs - à l'aide de l'intelligence artificielle - peuvent rechercher des niches utiles sur les surfaces de molécules défectueuses causant le cancer qui pourraient être utilisées par de nouveaux médicaments pour bloquer leur effet.
La base de données détient maintenant les structures 3D de près de 3 millions de niches à la surface de près de 110 000 molécules cancérogènes.
Une autre caractéristique nouvelle est que les scientifiques peuvent identifier des voies de communication pour bloquer les cellules tumorales internes.
Dr. Al-Lazikani dit que la base de données est la plus grande de son genre dans le monde avec plus de 140 000 utilisateurs de plus de 175 pays.
Elle et son équipe y ajoutent constamment, et "développent régulièrement de nouvelles technologies d'intelligence artificielle qui aident les scientifiques à faire des prédictions et des expériences de conception", ajoute-t-elle.
Le docteur Kat Arney, responsable de l'information scientifique chez Cancer Research UK, déclare que tout ce qui réduit le temps et le coût pour trouver de nouveaux traitements contre le cancer aidera à apporter la prochaine génération de médicaments aux patients, même plus tôt, et note:
Cette base de données met à la disposition des scientifiques du monde entier des informations scientifiques détaillées sur le cancer et accélérera les progrès décisifs dans la découverte de médicaments - en sauvant plus de vies ».
La base de données canSAR est disponible en ligne via l'ICR.
Pendant ce temps, Medical-Diag.com A récemment appris qu'un des essais cliniques sur les thérapies anticancéreux sur les thérapies contre le cancer n'ont pas réussi à recruter suffisamment de participants et, dans cette optique, un groupe de chercheurs a développé un algorithme pour aider à la conception et à la hiérarchisation des essais.
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