Un test unique pourrait détecter presque tous les virus


Un test unique pourrait détecter presque tous les virus

Un nouveau test qui détecte pratiquement n'importe quel virus qui infecte les personnes et les animaux a été développé par des chercheurs de l'École de médecine de l'Université de Washington à St. Louis, selon les résultats publiés dans le journal Recherche génomique .

Le nouveau test peut détecter une large gamme de virus, y compris le norovirus.

Beaucoup de milliers de virus sont connus pour causer des maladies chez les personnes et les animaux, et le diagnostic correct peut être un processus long et coûteux, impliquant de nombreux tests.

Les virus qui se produisent dans et sur le corps humain sont collectivement connus sous le nom de virome. Selon l'auteur principal de l'étude, le Dr Gregory Storch, professeur de pédiatrie de Ruth L. Siteman, dans un processus connu sous le nom de «séquençage amélioré de virome», les chercheurs ont développé un moyen de lancer un large réseau et de «détecter efficacement les virus présents à Niveaux très bas."

Aucun test jusqu'ici n'a été suffisamment sensible pour détecter de faibles niveaux de virus. De nombreux tests sont limités à détecter uniquement les virus soupçonnés d'être responsables de la maladie d'un patient.

Le nouveau test pourrait être utilisé pour détecter les épidémies de virus mortels tels que Ebola, Marburg et le syndrome respiratoire aigu sévère (SRAS), ainsi que des virus plus fréquents, y compris le rotavirus et le norovirus, qui provoquent des infections gastro-intestinales sévères.

L'équipe s'attend à ce que le test soit utile dans les cas où les tests standard ne révèlent pas de diagnostic ou lorsqu'on ne sait pas ce qui a causé une épidémie de maladie.

Le test révèle des virus non détectés par des tests standard

Le nouveau test - appelé ViroCap - a été montré dans des échantillons de patients pour détecter les virus non trouvés par les tests standard.

Les séquences d'essai et détecte les virus ayant la même sensibilité que les tests de réaction en chaîne par polymérase (PCR), qui sont largement utilisés dans les laboratoires cliniques et considérés comme «l'étalon-or».

Cependant, alors que les tests de PCR peuvent dépister jusqu'à environ 20 virus similaires en même temps, il semble que ViroCap puisse théoriquement tester pratiquement n'importe quel virus.

Pour développer le test, les chercheurs ont ciblé des étirements uniques d'ADN ou d'ARN de tous les groupes connus de virus qui infectent les humains et les animaux: 2 millions d'étendues uniques de matériel génétique en tout.

Ces étirements de matériaux sont utilisés comme sondes pour éliminer les virus dans les échantillons de patients qui sont une combinaison génétique. Le matériau viral apparié est ensuite analysé en utilisant un séquençage génétique à haut débit.

L'équipe suggère que, comme des virus complètement nouveaux sont découverts, leur matériel génétique pourrait facilement être ajouté au test.

L'évaluation montre que ViroCap devient 52% plus efficace

Les chercheurs ont évalué le nouveau test en prenant deux ensembles d'échantillons biologiques - par exemple, du sang, des selles et des sécrétions nasales - des patients de l'Hôpital St. Louis Children's.

Les tests standard ont détecté des virus chez 10 des 14 patients, mais le nouveau test a révélé des virus chez les quatre enfants que des tests antérieurs avaient manqués.

Les virus courants et quotidiens non détectés par le test standard incluent la grippe B, la cause de la grippe saisonnière, le parechovirus, un virus gastro-intestinal et respiratoire léger, le virus de l'herpès-1, responsable des rhume des nausées et du virus de la varicelle-zoster, qui provoque varicelle.

Dans un deuxième groupe d'enfants avec des fièvres inexpliquées, les tests standard ont détecté 8 virus sur 11, mais le nouveau test a révélé sept autres, y compris un virus respiratoire appelé adénovirus B type 3A humain, qui est habituellement inoffensif, mais peut causer des infections graves chez certains patients.

Au total, le nombre de virus détectés dans les deux groupes de patients a augmenté de 21 à 32, soit une augmentation de 52%.

Le nouveau test permet également d'identifier facilement des sous-types de virus, car il comprend des informations génétiques détaillées sur diverses souches de virus particuliers.

Par exemple, bien que les tests standard identifient un virus comme grippe A, qui provoque une grippe saisonnière, le nouveau test indique que le virus était un sous-type particulièrement sévère appelé H3N2.

La dernière saison de la grippe, H3N2 a contribué à environ 36 000 décès aux États-Unis. Cette information pourrait conduire à un traitement plus efficace chez les patients tels que les jeunes enfants, les personnes âgées et les personnes ayant des systèmes immunitaires affaiblis.

L'auteur de l'étude Todd Wylie dit:

Le test est si sensible qu'il détecte également les variantes de virus qui sont étroitement liés génétiquement. De légères variations génétiques parmi les virus ne peuvent souvent pas être distinguées par les tests actuellement disponibles et compliquent la capacité des médecins de détecter toutes les variantes avec un test ".

La technologie développée est mise à la disposition des scientifiques et des cliniciens du monde entier pour le bénéfice des patients et de la recherche.

De plus amples recherches sont nécessaires pour valider la précision du test, ce qui signifie que cela peut être plusieurs années avant qu'il soit cliniquement disponible, mais les scientifiques pourront utiliser la technologie pour étudier les virus dans un contexte de recherche.

Les auteurs espèrent également que cela pourrait être modifié pour détecter les agents pathogènes autres que les virus, comme les bactéries, les champignons et d'autres microbes. Il pourrait également apparaître des gènes qui indiqueraient qu'un agent pathogène résiste au traitement par des antibiotiques ou d'autres médicaments, selon la co-auteur Kristine Wylie.

Le nouveau test permettra une meilleure compréhension de ces virus et le rôle qu'ils jouent pour garder le corps en bonne santé.

Plus tôt cette année, Medical-Diag.com Rapporté sur un test appelé VirScan que les chercheurs disent peut détecter l'histoire virale entière d'une personne en scrutant une seule goutte de sang.

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