La simulation par ordinateur de l'enzyme améliore la compréhension de l'hépatite c


La simulation par ordinateur de l'enzyme améliore la compréhension de l'hépatite c

Une équipe de scientifiques a créé une simulation par ordinateur d'une enzyme appelée NS3 qui joue un rôle important en aidant le virus de l'hépatite C à se reproduire et à se propager dans le corps. La découverte devrait aider à la recherche de médicaments qui visent uniquement le virus.

L'image montre l'enzyme NS3 en action sur le dérachement de l'ARN viral.

Crédit d'image: SISSA

Les scientifiques de l'École internationale d'études avancées (SISSA) à Trieste, en Italie, décrivent leur travail dans le journal Recherche sur les acides nucléiques .

Au fur et à mesure que les scientifiques commencent à mieux comprendre comment un virus particulier se reproduit, mieux sont les chances de trouver des médicaments qui empêchent la propagation du virus.

L'équipe a décidé d'analyser NS3 car elle est spécifique au virus de l'hépatite C. Ils notent qu'un médicament qui cible l'enzyme de manière sélective ne causerait pas d'effets secondaires dans le reste du corps.

Mais pour pouvoir cibler NS3, les scientifiques doivent en savoir plus sur la façon dont il se comporte. Jusqu'à présent, les seules connaissances proviennent d'instantanés - images fixes - de l'enzyme obtenue grâce à des études de cristallographie.

La nouvelle simulation informatique offre aux chercheurs la première occasion d'observer le comportement de NS3 comme si on regardait un film en mouvement.

NS3 est une hélicase - une enzyme qui interagit avec l'ARN du virus (les virus n'ont pas d'ADN, leur code génétique est détenu dans l'ARN).

NS3 'rampe le long de l'ARN viral comme une chenille'

NS3 aide à démêler et à préparer l'ADN viral pour la replication, un processus impliquant une deuxième enzyme appelée polymérase. Le premier auteur et étudiant de SISSA Andrea Pérez-Villa explique:

"NS3 se rapproche du fil de l'ARN qui se contracte et s'étend comme une chenille et, dans cette mesure, il libère la partie du virus à laquelle la polymérase attache ensuite."

La simulation informatique de l'équipe montre non seulement comment NS3 interagit avec l'ARN viral, mais aussi la façon dont le procédé utilise l'ATP - les unités chimiques d'énergie que les protéines consomment au fur et à mesure de leur travail.

L'auteur principal Giovanni Bussi, professeur et chef d'un groupe SISSA qui effectue des simulations informatiques pour étudier l'ARN, affirme que leur modèle reproduit «l'interaction avec l'ATP et ensuite avec ADP, un produit de rebut associé au phosphate, après l'utilisation de l'ATP». Il conclut:

En connaissant en détail comment fonctionne cette hélicase, dans le futur, nous pourrions tenter de bloquer la réplication virale et donc empêcher la prolifération de la maladie dans le corps ".

La série suivante de vidéos de SISSA montre la simulation par ordinateur de NS3 interagissant avec l'ADN viral.

Selon l'Organisation mondiale de la santé (OMS), 130 à 150 millions de personnes dans le monde ont une infection chronique contre l'hépatite C et environ un demi-million de personnes meurent chaque année d'une maladie du foie liée à l'infection.

Pendant ce temps, Medical-Diag.com A récemment signalé comment les scientifiques ont découvert un groupe de cellules régénératrices du foie qui peuvent reconstituer le tissu hépatique endommagé sans produire de tumeurs dangereuses.

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