Des chercheurs de Harvard T.H. Chan School of Public Health à Boston, MA, ont montré dans une nouvelle étude que les communautés microbiennes trouvées à l'intérieur et sur les corps des individus - appelés microbiome - ont le potentiel d'identifier individuellement les individus.

Les «empreintes digitales» microbiennes obtenues à partir d'échantillons d'intestins ont été trouvées par les chercheurs comme étant particulièrement stables.

L'étude, publiée en Actes de l'Académie nationale des sciences , Est le premier à démontrer la faisabilité d'utiliser des données personnelles sur les microbiomes pour identifier les individus, bien qu'il suggère également qu'il pourrait y avoir des problèmes de confidentialité pour les participants aux projets de recherche sur les microbiomes humains.

L'auteur principal Eric Franzosa, un chercheur du département de bioéthique de Harvard Chan, déclare que, depuis des décennies, le domaine de la génétique légale a été basé sur la liaison des échantillons d'ADN humains avec une base de données sur les «empreintes digitales» de l'ADN humain.

"Nous avons montré que le même type de liaison est possible en utilisant des séquences d'ADN à partir de microbes habitant le corps humain - aucun ADN humain requis", explique Franzosa.

"Cela ouvre la porte à la connexion d'échantillons de microbiome humains entre des bases de données, ce qui permet d'exposer des informations sujettes sensibles - par exemple, une infection sexuellement transmissible, détectable à partir de l'échantillon de microbiome lui-même".

Dans un corps humain moyen, il y a en moyenne 10 fois plus de bactéries que les cellules humaines. Ces bactéries jouent un rôle de premier plan dans le maintien de la santé en produisant des vitamines, en éliminant les aliments, en soutenant le système immunitaire et en produisant des composés anti-inflammatoires.

Lorsque le microbiome est perturbé, des problèmes de santé tels que l'inflammation intestinale peuvent se produire. Des études récentes publiées au cours des 6 derniers mois ont également fait des associations entre le microbiome, en particulier dans l'intestin, avec des affections telles que la maladie de Parkinson, les allergies alimentaires et l'asthme et la production de la sérotonine.

La plupart des «codes» individuels se sont révélés stables après un an

Pour l'étude, les chercheurs ont analysé les données obtenues à partir du projet Microbiome humain. Ils ont étudié les microbes de la salive, de la peau, des selles et d'autres sites corporels de 242 participants pendant plus d'un mois.

Avec l'aide d'un algorithme informatique adapté, les chercheurs ont créé des «codes» spécifiques pour chaque individu. Ces codes ont été construits en combinant des caractéristiques de séquence stables et distinctives à partir des échantillons de microbiome.

Ces codes spécifiques individuels ont ensuite été comparés aux échantillons de microbiome obtenus auprès des mêmes personnes lors de visites de suivi, ainsi qu'avec des échantillons prélevés auprès de groupes indépendants d'individus.

Les chercheurs ont constaté que non seulement les codes étaient uniques parmi les centaines d'individus, mais qu'un nombre important de ceux-ci restaient stables pendant une période d'échantillonnage de 1 an. Les codes construits en utilisant les données obtenues à partir de l'intestin étaient particulièrement stables, avec plus de 80% restant identifiables jusqu'à un an après la période d'échantillonnage initiale.

L'auteur principal Curtis Huttenhower, professeur agrégé de biologie informatique à Harvard Chan, affirme qu'il est important pour les chercheurs de savoir qu'il est théoriquement possible que les problèmes de confidentialité des données se produisent avec l'ADN microbien, même si le potentiel est assez faible. L'étude démontre que des échantillons provenant d'une variété de sites corporels peuvent être liés à des individus sans information d'identification supplémentaire.

Cependant, il croit qu'un autre aspect de leur recherche est plus intéressant:

Peut-être même plus excitant sont les implications de l'étude pour l'écologie microbienne, car il suggère que nos résidents microbiens uniques sont syntonisés dans l'environnement de notre corps - notre génétique, notre alimentation et notre histoire de développement - de manière à ce qu'ils adhèrent à nous et aident à Défendre les envahisseurs microbiens moins amicaux au fil du temps."

"Bien que les populations considérées ici soient petites par rapport aux communautés humaines du monde réel (20 à 50 individus), nous estimons que cette limite inférieure de l'identification de microbiome varie à au moins des centaines d'individus et cette taille de population est représentative des cohortes Actuellement utilisé dans la recherche sur les microbiomes ", concluent les auteurs.

La recherche a été financée en partie par les National Institutes of Health (NIH).

Medical-Diag.com A précédemment dirigé une fonction Spotlight sur la façon dont le microbiome intestinal affecte notre santé, en trouvant qu'un microbiome plus diversifié est mieux pour la santé et qu'il existe plusieurs façons dont les bactéries intestinales peuvent être modifiées.

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