Une nouvelle étude menée par un consortium de recherche américain a révélé qu'un petit segment du chromosome 16 est soit manquant ou reproduit dans environ 1 pour cent des personnes souffrant d'un trouble du spectre autistique (ASD). Ce qui est surprenant pour cette découverte particulière, c'est que l'omission ou la duplication n'est pas héritée d'un parent mais semble se produire spontanément, peut-être à l'époque de la conception.

L'étude est publiée dans le premier numéro en ligne du 9 janvier de la New England Journal of Medicine (NEJM) Et est le travail du Consortium Autisme, qui regroupe 14 universités et centres médicaux de premier plan dans et autour de Boston, dans le Massachusetts.

Les troubles du spectre autistique (ASD) sont diagnostiqués chez 1 enfant sur 150 inférieur à trois ans. Les symptômes varient de légère à sévère, et ont des composants sociaux, cognitifs et comportementaux.

La fréquence de 1 pour cent est comparable à un certain nombre d'autres syndromes génétiques qui ont été liés aux TSA, ont déclaré les chercheurs. En outre, environ 90% des ASD sont censés avoir une composante génétique, mais jusqu'à présent, seulement 10% des cas peuvent être liés à des syndromes génétiques et chromosomiques connus.

Le Dr Mark Daly, qui travaille au Centre d'étude génétique humaine du Massachusetts General Hospital (MGH) et chercheur principal de l'équipe de découverte de gènes de l'étude, a déclaré:

"Alors que les études épidémiologiques indiquent un très grand élément génétique de l'autisme, on sait peu de choses sur la façon dont les gènes spécifiques sont impliqués".

Daly est membre du Autism Consortium et est professeur adjoint de médecine à la Harvard Medical School et membre du Broad Institute de Harvard et Massachusetts Institute of Technology.

"Nous sommes encore loin de comprendre comment cette suppression ou duplication chromosomique augmente le risque pour l'autisme, mais c'est une première étape critique vers cette connaissance", a ajouté Daly.

Les scientifiques connaissaient déjà plusieurs suppressions de chromosomes ou des doublons liés aux ASD, y compris un type particulier de suppression sur le chromosome 15 transmis par un parent. Ainsi, dans cette étude, les chercheurs ont décidé d'effectuer une analyse complète du génome.

Ils ont utilisé des échantillons de l'Autism Genome Research Exchange, qui détient de l'ADN provenant de familles avec au moins un enfant atteint de TSA.

Les chercheurs ont scanné plus de 1 400 échantillons d'individus atteints de TSA et un nombre similaire de parents non touchés. Ils ont constaté qu'une région particulière du chromosome 16 a été supprimée dans 5 des individus atteints d'ASD, mais pas chez aucun de leurs parents. Cela suggère que la suppression a eu lieu spontanément et n'a pas été héritée.

Daly et ses collègues ont confirmé ces résultats en examinant les données cliniques d'un groupe séparé de près de 1 000 patients qui avaient fréquenté l'Hôpital pour enfants de Boston, dont environ la moitié avaient un diagnostic d'ASD ou un trouble apparenté.

Parmi ceux qui ont une ASD ou un trouble apparenté, ils ont trouvé 5 enfants avec la même suppression du chromosome 16 et 4 autres enfants où le segment chromosomique n'a pas été supprimé mais a été reproduit. Ces défauts chromosomiques n'étaient pas présents dans l'ADN des enfants qui n'étaient pas diagnostiqués avec une ASD ou un trouble apparenté.

Les résultats ont été confirmés à nouveau par un autre ensemble de données obtenues de deCODE Genetics, une société biopharmaceutique en Islande qui utilise des études de population pour identifier les gènes humains liés à des maladies communes. Ils ont trouvé la même suppression dans 3 de près de 300 personnes atteintes de TSA, et aussi dans certains échantillons de personnes ayant des troubles psychiatriques ou linguistiques. La suppression a été retrouvée dans seulement 2 membres sur 20 000 de la base de données DECODE qui n'ont pas été diagnostiqués avec un trouble associé.

Une analyse plus approfondie des données de deCODE a suggéré que si cette suppression de chromosome était susceptible d'être présente dans seulement 0,01% de la population générale, il était 100 fois plus susceptible de se retrouver chez les personnes atteintes d'un TSA.

Daly a expliqué que:

"Ces grandes délétions chromosomiques non héritées sont extrêmement rares, donc trouver précisément la même suppression dans une proportion aussi importante de patients suggère que c'est un facteur de risque très important pour l'autisme".

«Nous poursuivons maintenant des études génétiques plus détaillées pour déterminer quels gènes dans cette région sont responsables de cet effet afin de mieux comprendre la biologie sous-jacente et les indices potentiels des approches thérapeutiques», a-t-il ajouté.

Dans un éditorial qui l'accompagne, les Drs Evan E. Eichler, de l'Institut médical Howard Hughes et du Département des sciences de la génome, de l'Université de Washington, de Seattle et Andrew W. Zimmerman, du Kennedy Krieger Institute et de l'Université Johns Hopkins de Baltimore, ont écrit que La découverte de la suppression spontanée ou la duplication d'un segment d'un chromosome annonce un nouveau «paradigme» dans la recherche génétique des TSA. Les exemples cités dans cette étude pourraient être la «pointe de l'iceberg».

"Une collecte approfondie des échantillons et de nouvelles techniques génomiques rentables peuvent être nécessaires pour éplucher les couches restantes de l'oignon", a écrit Eichler et Zimmerman.

Ce type de suppression de chromosome et de découverte de duplication a également des implications cliniques immédiates, selon une déclaration publiée par le Consortium d'autisme au début de la semaine.

Un nouveau type de test appelé microarray chromosomique est maintenant utilisé dans des contextes cliniques. Cela peut détecter la suppression et les doublons des chromosomes chez les patients diagnostiqués et leurs parents et aide les cliniciens à évaluer le risque de récidive lors des grossesses ultérieures, ce qui inquiète pour de nombreux parents.

Mais les tests coûtent cher et ne sont pas toujours couverts par une assurance. Les chercheurs du Consortium travaillent sur des moyens de réduire les coûts, par exemple en développant un test plus simple pour détecter le défaut spécifique du chromosome 16.

"Association entre Microdeletion et Microduplication au 16p11.2 et Autisme.

Weiss, Lauren A., Shen, Yiping, Korn, Joshua M., Arking, Dan E., Miller, David T., Fossdal, Ragnheidur, Saemundsen, Evald, Stefansson, Hreinn, Ferreira, Manuel AR, Green, Todd, Platt, Orah S., Ruderfer, Douglas M., Walsh, Christopher A., ​​Altshuler, David, Chakravarti, Aravinda, Tanzi, Rudolph E., Stefansson, Kari, Santangelo, Susan L., Gusella, James F., Sklar, Pamela, Wu, Bai-Lin, Daly, Mark J., le Consortium d'autisme.

N Engl J Med , Publié en ligne le 9 janvier 2008, imprimé le 14 février 2008.

DOI: 10.1056 / NEJMoa075974.

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"Un point chaud d'instabilité génétique dans l'autisme.

Evan E. Eichler et Andrew W. Zimmerman.

N Engl J Med , Publié en ligne le 9 janvier 2008, imprimé le 14 février 2008.

DOI: 10.1056 / NEJMe0708756.

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Sources: communiqué de presse du NEJM, article du journal et éditorial, communiqué de presse Autisme Consortium.

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